Bij de aanleg van de RijnGouwelijn werken diverse overheden met elkaar samen: de provincie Zuid-Holland, de afzonderlijke gemeenten langs het tracé en het samenwerkingsorgaan Holland Rijnland. Om ieders taken en verantwoordelijkheden te ordenen en vast te leggen zijn er onder de noemer bestuurlijke overeenkomsten de nodige afspraken op papier gezet.
Ondertekening BO IV met Zoeterwoude
op 7 juli 2006
RijnGouwelijn-Oost
Bestuursovereenkomst 1
Het begon allemaal in 2003 met een Intentieovereenkomst voor de RGL-Oost. Die resulteerde uiteindelijk in Bestuursovereenkomst 1. De provincie en de betrokken gemeenten zetten daar in juli 2005 hun handtekeningen onder.
Bestuursovereenkomst 2
Bestuursovereenkomst 2 regelt de inpassing van de RijnGouwelijn in Leiden. Een eerste versie daarvan stamt uit 2005, maar is uiteindelijk nooit ondertekend. De commotie rond het oorspronkelijke traject door de Breestraat in Leiden leidde tot een referendum (maart 2007), tot een nieuw college in Leiden en uiteindelijk ook tot de definitieve versie van Bestuursovereenkomst 2. Daarin is vastgelegd dat de trams over een dubbelsporig tracé via de Hooigracht en de Langegracht gaan rijden. Voorwaarde is dat die straten autoluw worden en dus dat Leiden een Ringweg-Oost krijgt. Deze bestuursovereenkomst is door de provincie en de gemeente Leiden in december 2008 bekrachtigd.
Bestuursovereenkomst 3
In Bestuursovereenkomst 3 (ondertekend in 2006) staan afspraken tussen de provincie en de gemeente Gouda, vanwege de gewenste maaiveldligging van het tracédeel in de Goudse spoorzone.
Bestuursovereenkomst 4
In Zoeterwoude komen ter hoogte van de Elfenbaan opstelsporen en een werkplaats voor de trams van de RijnGouwelijn. De afspraken daarover staan in Bestuursovereenkomst 4, die in 2006 is ondertekend door de provincie en de gemeente Zoeterwoude.
RijnGouwelijn-West
Ook voor de RijnGouwelijn-West is er een bestuursovereenkomst. Die werd op 1 maart 2010 ondertekend door de provincie, de regio Holland Rijnland en de gemeenten Katwijk en Oegstgeest. Vanwege het regionale belang van de RijnGouwelijn besloot de provincie dat er een inpassingsplan komt voor de RijnGouwelijn-West. Dat plan geldt dan als een overkoepelend bestemmingsplan voor de smalle strook grond waarop de tramrails komt.
